悬空寺的设计与选址是其得以保存完好的另一个重要原因。它背倚翠屏峰的崖壁，所处位置正是石崖向内凹进的地方，石崖的突出部分好像一把伞，使悬空寺免受雨水冲别和落石袭击；较高的地理位置规避了洪水泛滥的危险；金龙口的山风吹走了河谷的水汽，保持了干澡的自然环境；四周的山峦减少了阳光的照射时间，避免暴晒而引起木材风化，不知道当年的工匠是否考虑到了这么多复杂的因素，不过其位置的确得天独厚。